Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD1Q8NHV4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms