Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM58Q8NG06 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms