Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL22A1Q8NFW1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL22A1Q8NFW1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL22A1Q8NFW1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms