Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
NGDNQ8NEJ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NGDNQ8NEJ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NGDNQ8NEJ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NGDNQ8NEJ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NGDNQ8NEJ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NGDNQ8NEJ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NGDNQ8NEJ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NGDNQ8NEJ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NGDNQ8NEJ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NGDNQ8NEJ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NGDNQ8NEJ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NGDNQ8NEJ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NGDNQ8NEJ9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms