Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOF1Q8ND07 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms