Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCR6

SMRP1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMRP1Q8NCR6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMRP1Q8NCR6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMRP1Q8NCR6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMRP1Q8NCR6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMRP1Q8NCR6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMRP1Q8NCR6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMRP1Q8NCR6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMRP1Q8NCR6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMRP1Q8NCR6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMRP1Q8NCR6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMRP1Q8NCR6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms