Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRYD3Q8NCJ5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPRYD3Q8NCJ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPRYD3Q8NCJ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPRYD3Q8NCJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPRYD3Q8NCJ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPRYD3Q8NCJ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms