Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HJURPQ8NCD3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms