Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms