Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP38Q8NB14 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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