Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSIP1Q8NA03 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms