Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C12orf29Q8N999 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf29Q8N999 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms