Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms