Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRBD1Q8N5C6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRBD1Q8N5C6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms