Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms