Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms