Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLASRPQ8N2M8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms