Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC47Q8N1G4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC47Q8N1G4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LRRC47Q8N1G4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC47Q8N1G4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC47Q8N1G4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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