Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms