Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC103Q8IW40 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC103Q8IW40 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms