Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APLFQ8IW19 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APLFQ8IW19 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APLFQ8IW19 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APLFQ8IW19 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APLFQ8IW19 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APLFQ8IW19 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APLFQ8IW19 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APLFQ8IW19 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms