Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms