Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms