Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALYREFQ86V81 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms