Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms