Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF3Q7Z739 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms