Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms