Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms