Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTF1AQ7RTS3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms