Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms