Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms