Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCQ7LC44 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms