Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms