Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms