Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHISA6Q6ZSJ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms