Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms