Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms