Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM72Q6ZMU5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms