Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms