Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK4Q6SA08 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK4Q6SA08 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSSK4Q6SA08 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms