Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q4G3

LVRN, Aminopeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 990 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LVRNQ6Q4G3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LVRNQ6Q4G3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LVRNQ6Q4G3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LVRNQ6Q4G3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LVRNQ6Q4G3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LVRNQ6Q4G3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LVRNQ6Q4G3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LVRNQ6Q4G3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LVRNQ6Q4G3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LVRNQ6Q4G3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LVRNQ6Q4G3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LVRNQ6Q4G3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LVRNQ6Q4G3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LVRNQ6Q4G3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms