Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms