Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF549Q6P9A3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF549Q6P9A3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms