Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms