Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB12Q6NXP0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms