Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms