Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC8EQ6NSJ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms