Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCTP1Q6DN14 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms