Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USPL1Q5W0Q7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms