Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ECM29Q5VYK3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms